Закладку в треке делаем посредством команды Воспроизведение -> Закладка для текущей позиции
Удаляем закладку в треке командой Воспроизведение -> Удалить закладку позиции
Каждый трек размечается отдельно
Сняв и снова вернув галочку Пропуск треков и закладки, метки сохраняются
Если закладку в треке сделать не получается, значит у вас в свойствах файла стоит галочка, Только чтение, снимите её
Статистика переносится из сборки в сборку при обновлении проигрывателя

• Как это будет выглядеть на практике

Например, в треке Павел Воля - Всё будет офигенно, я делаю закладку, далее всегда, при воспроизведении, этот трек будет звучать не сначала, а со слов, "всё будет офигенно" (это для конкурса)
Таким же методом можно в начале трека "подрезать" нудное начало